Tính đến ngày 31/12/2024, Đảng bộ thành phố có 58 tổ chức cơ sở đảng (TCCSĐ) và 12.600 ĐV. Thực hiện Quyết định số 1971-QĐ/TU, ngày 21/1/2025 của Ban Thường vụ Tỉnh ủy về “Chuyển giao tổ chức đảng và đảng viên”, Ban Thường vụ Thành ủy tiếp nhận về Đảng bộ TP. Đồng Hới 4 TCCSĐ, 171 ĐV từ Đảng bộ Khối các cơ quan tỉnh và 36 TCCSĐ, 1.049 ĐV từ Đảng bộ Khối doanh nghiệp tỉnh. 

Sau khi tiếp nhận, Đảng bộ thành phố có 98 TCCSĐ (41 đảng bộ cơ sở, 57 chi bộ cơ sở) và 13.820 ĐV. Trong số 57 chi bộ cơ sở có 5 chi bộ trên 30 ĐV (đủ điều kiện thành lập đảng bộ); 13 chi bộ có từ 20-30 ĐV; 39 chi bộ có từ 19 ĐV trở xuống.

Trên cơ sở đó, Ban Thường vụ Thành ủy chuyển một số TCCSĐ về Đảng bộ Cơ quan chính quyền thành phố và các đảng bộ xã, phường. 

Sau khi tiếp nhận và chuyển giao các TCCSĐ về cơ sở, Đảng bộ thành phố còn lại 60 TCCSĐ (41 đảng bộ cơ sở và 19 chi bộ cơ sở).